Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

- _ -

• __call__() : singleton.SingletonMeta
• __init__() : config_manager.Config, option_manager.Option, StrokeSegLab.entrypoints.cli.CLIMain, StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain, StrokeSegLab.inference.inference.Inference, StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor, StrokeSegLab.postprocessing.viewer.Viewer, StrokeSegLab.preprocessing.brain_extraction.BrainExtracter, StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor, StrokeSegLab.preprocessing.resampling.Resampler, StrokeSegLab.utils.wrapper.AnimaWrapper
• _bet() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _bias_correct() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _binarize_seg() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor
• _check_device() : StrokeSegLab.entrypoints.cli.CLIMain, StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _check_path_filled() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _compute_gaussian() : StrokeSegLab.inference.inference.Inference
• _compute_new_shape() : StrokeSegLab.preprocessing.resampling.Resampler
• _compute_steps() : StrokeSegLab.inference.inference.Inference
• _convert_to_segmentation() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor
• _create_nonzero_mask() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _crop_to_nonzero() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _determine_do_sep_z_and_axis() : StrokeSegLab.preprocessing.resampling.Resampler
• _get_do_separate_z() : StrokeSegLab.preprocessing.resampling.Resampler
• _get_lowres_axis() : StrokeSegLab.preprocessing.resampling.Resampler
• _import_model() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _load_img() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _on_close() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _on_mode_change() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _on_model_change() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _padding() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _predict() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _preprocess_modality() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _print_action() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor, StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _register_seg_to_reference() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor
• _register_to_reference() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _remove_padding() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor
• _reorient_RAS() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor
• _resample_data_or_seg() : StrokeSegLab.preprocessing.resampling.Resampler
• _run() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _run_bet() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _run_prediction() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _save_img() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor
• _select_input_file() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _select_input_folder() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _select_model() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _show_about() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _show_help() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _show_import_model() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _show_threshold() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _stop() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _uncrop_from_bbox() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor
• _update_result() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _update_stringvar() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• _z_score_norm() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor

- c -

• check_stop() : StrokeSegLab.entrypoints.gui.GUIMain
• check_viewer() : StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor, StrokeSegLab.postprocessing.viewer.Viewer
• clear() : config_manager.Config

- f -

• find_nii_files() : StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor

- g -

• get() : config_manager.Config, option_manager.Option

- i -

• import_model() : StrokeSegLab.entrypoints.cli.CLIMain

- r -

• run() : StrokeSegLab.entrypoints.cli.CLIMain, StrokeSegLab.inference.inference.Inference, StrokeSegLab.postprocessing.postprocessor.Postprocessor, StrokeSegLab.postprocessing.viewer.Viewer, StrokeSegLab.preprocessing.brain_extraction.BrainExtracter, StrokeSegLab.preprocessing.preprocessor.Preprocessor, StrokeSegLab.preprocessing.resampling.Resampler, StrokeSegLab.utils.wrapper.AnimaWrapper

- s -

• save() : config_manager.Config
• set() : config_manager.Config, option_manager.Option
• show_models() : StrokeSegLab.entrypoints.cli.CLIMain

- u -

• update_path() : StrokeSegLab.postprocessing.viewer.Viewer